Emilio Pujol đến với âm nhạc qua nghề ca hát và cây đàn bandurria - ông là tay độc tấu bandurria trong một ban nhạc Mandoline-Guitar.  Ban nhạc này đã trình diễn ở Paris vào năm 1900 và đạt thành công lớn.  Cũng chính năm 1900, Pujol chuyển sang đàn guitar và trở thành học trò của Francisco Tarrega tại Barcelona. Sau khi đã nổi tiếng lừng lẫy khắp Tây Ban Nha, năm 1907 ông bắt đầu đi lưu diễn ở Argentina, Uruguay và Mỹ.

Pujol kết hôn với Mathilde Cuervas, một nữ danh cầm guitar flamenco. Họ cùng chơi song  tấu tại nhiều quốc gia, trong đó có lần biểu diễn rất thành công tại Anh vào năm 1923. Năm 1924 Pujol phát hiện ra một cây đàn vihuela cổ trong viện bảo tàng Paris.  Nhạc cụ này đã hấp dẫn ông và từ đó ông đã trở thành một trong những nhân vật  quan trọng đã làm sống lại nhạc cụ này.

Năm 1947 Pujol được bổ làm giáo sư guitar tại Nhạc viện quốc gia Lisbon, Bồ Đào Nha, và giữ chức vụ này đến khi mất vào năm 1980.

Pujol không những là một người thầy, một nghệ sĩ guitar lỗi lạc mà còn là một nhà nghiên cứu âm nhạc xuất sắc của thế kỷ 20.  Ông đã viết nhiều tác phẩm quan trọng về guitar, trong đó có quyển "Rationale Method for the Guitar", "The Dilemma of Timbre on the Guitar", và tiểu sử người thầy của ông là Francisco Tarrega.

.